火影忍者手游中秘境探险是提升战力的重要途径，但不同秘境对战力要求差异较大。烈炎秘境作为入门级副本，简单难度推荐战力约12.5万，困难难度需18.9万，修罗难度则要求26.7万以上。毒风秘境难度更高，简单模式需34.9万战力，困难模式49.7万，修罗模式则需达到65.5万战力才能稳定通关。抗魔值同样关键，烈炎秘境修罗难度要求2210抗魔，毒风秘境修罗难度需4500抗魔值，若未达标会导致副本敌人异常强大。
烈炎秘境的BOSS会释放火壁和地火攻击，需保持中距离输出避免灼伤，优先选择技能冷却短、攻击范围远的忍者。毒风秘境需破解封印机制，优先击杀右侧忍偶解除结界，否则持续掉血将大幅增加通关难度。落岩秘境推荐使用滞空型忍者，需躲避地面突刺和陨石攻击，把握BOSS藏身石像的停顿时机爆发输出。
神器升级可提供可观战力加成，优先强化前两槽位，白牙神器因加成较低可暂缓培养。饰品系统六部位需通过秘境获取，品质分为普通至传说四级，属性搭配应根据忍者特性调整，输出型优先攻击暴击，生存型侧重生命防御。组织商店每周需换满忍玉，小队突袭建议开三倍获取资源，轮回石在玉石商店的优先级高于S忍碎片。
每日前三次秘境建议勾选奖励翻倍使收益最大化，组队可获得属性加成且无论成败都能领取当日奖励。高等级玩家带低战队友时，副本难度按房主等级计算，但饰品掉落品质会相应降低。秘境积分达2000可兑换传说饰品，品质与当前抗魔值挂钩。长期规划建议先积累过渡饰品提升基础战力，再逐步挑战高阶秘境。
