装甲系统的强化是舰队生存能力的核心保障，其加点优先级需根据舰船定位和战场环境动态调整。对于承担前排抗伤任务的重甲舰船（如ST59战巡、奇美拉防护型），应优先点满物理装甲抵抗与能量护盾强化，这两项直接提升对实弹和能量武器的减伤效果。淬火处理与能量涂层可同步激活，前者提升基础装甲值，后者针对能量武器特化防御。若技术值充裕，可补充近距隐身涂层以提升对导弹和鱼雷的闪避率，但该属性对主力抗伤舰的收益低于基础防御属性。
中排输出型舰船的装甲强化需兼顾生存与功能平衡。以艾奥级巡洋舰为例，优先选择能量中和装置抵消能量伤害，随后补充基础护甲淬火。这类舰船不宜过度投入装甲技术值，通常保留20%-30%点数用于动力系统的闪避强化或武器系统冷却缩减。特殊情况下，若舰队缺乏前排保护，可临时调整为全防御加点，但会显著降低输出效率。支援型舰船（如诺玛奶船）的装甲强化以基础血量为主，优先激活结构强化模块，避免被敌方战机快速击溃。
护航艇与小型舰船的装甲加点存在明显差异。鳐装甲护航艇虽定位为B级防御，但其强化重点应放在隐身涂层（提供15%导弹闪避和25%鱼雷闪避），而非传统护甲值提升。护卫舰中的刺水母则依赖闪避属性而非硬抗伤害，装甲系统仅需点出最低限度的基础抵抗。这类轻型单位若错误采用战列舰式全防御加点，会严重浪费其机动优势。
后期高烈度对抗中，装甲系统的策略性调整尤为关键。面对以VB轰炸机为主的空中压制时，全舰队需统一强化能量护盾涂层；遭遇谷神星战术驱逐舰等实弹火力集群时，则切换为物理装甲优先。部分特殊装备如富贵装甲可突破常规加点逻辑，允许同时提升电子战抗性和基础防御，此类装备应作为战术变阵的备用方案。
技术值分配需遵循边际效益递减原则，单系统强化超过80%后收益急剧下降。建议将装甲系统的总投入控制在舰船技术值的40%-60%，剩余点数分配给武器或动力系统。实战中可通过战斗数据模拟装置反复测试不同加点组合，最终形成兼顾舰队协同与个体生存的最优方案。
